Inaugurado no dia 6 de junho de 2012, o InsCer teve origem no grupo de pesquisa em neurociências do Instituto de Pesquisas Biomédicas da PUCRS, com o objetivo de atuar em pesquisa e desenvolvimento translacional em saúde, isto é, por meio de pesquisas que tragam impacto efetivo à vida das pessoas.
No dia 9 de novembro de 2020, a instituição teve a sua estrutura ampliada, encerrando o projeto original de um espaço com 9.335 metros quadrados.